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大连医科大学附属第二医院科研中心（原实验中心）于2003年通过国家中医药管理局认证，成为国家中医药管理局中医药科研实验室，分子生物学实验室为国家中医药管理局指定的定点三级实验室。平台主要围绕肿瘤分子靶向治疗、肿瘤分子病理学、疾病相关基因变异检测方法学、微生物药物靶标及检测等研究方向，开展相关基础研究及应用研究。平台现有固定人员11名，其中博士6人，硕士3人。“十三五”期间平台工作人员承担国家自然科学基金项目8项、省级科研项目7项，市级科研项目1项，以第一/通讯作者发表SCI论文22篇，获得省市科技奖励1项。
同时，科研中心也是大医二院广大医教研工作者、研究生科研实践工作的基地。科研中心由公共平台、省市级重点实验室以及特色专科实验室组成。“十三五”期间，科研中心公共平台进行了新一轮的规划与改革，划分为病理形态学实验室、细胞生物学实验室、生物化学实验室、分子生物学实验室、微生物学实验室、贵重仪器室等多个功能性实验室，平台功能日益完备，一定程度上带动了我院员工和研究生的科研积极性。“十三五”期间，平台申请总人数500余人，承担包括国家863计划、国家自然科学基金重点项目在内的国家、省、市级和院内基金等项目近200项。另一方面，在我院每年获得的国家自然科学基金等项目中，相当大比例的申请者都是以在科研中心公共平台完成的研究工作为重要的前期基础而获得项目资助的。因此，公共平台一定程度上推动了医院整体科研水平的提高，也已成为培育国家自然科学基金等项目的重要基地。